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中國醫學科學院腫瘤醫院位于北京市，醫院注重科學研究。設有分子腫瘤學國家重點實驗室1個，北京市重點實驗室1個，基礎研究室4個，基礎與臨床應用研究中心2個，并設有為科研、臨床服務的中心實驗室。建院四十七年來，共獲科研成果160余項，其中58%為部級以上成果獎，食管癌的現場防治研究被評為1995年全國十大科技成就之一。
